Le dépôt des données de la recherche
Les entrepôts
Un entrepôt de données est « une infrastructure de stockage et de services facilitant le dépôt, la description, le partage en accès ouvert, la découverte et la réutilisation, par des humains ou des machines, de jeux de données […]. Ces jeux de données sont associés à des métadonnées et sont conservés à moyen ou long terme. » (Comité pour la science ouverte, 2024).
Déposer ses données dans un entrepôt rend possible leur réutilisation et ouvre la porte à de nouvelles collaborations.
C’est une pratique encouragée dans le contexte de la science ouvert et déposer ses données de recherche dans un entrepôt de données est désormais une étape incontournable de la gestion des données d’un projet.
Ces entrepôts s’inscrivent dans une démarche de partage et d’ouverture des données selon les principes FAIR pour que les données soient « Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables et Réutilisables » (en anglais : Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).
Pourquoi déposer dans un entrepôt de données ?
- Pour conserver ses données dans un environnement sécurisé ;
- Pour donner de la visibilité aux données et faciliter l’accès pour les moteurs de recherche ;
- Pour permettre l’interopérabilité des données grâce à l’utilisation de standards de métadonnées ;
- Pour permettre la découverte, la réutilisation et la citation du jeu de données grâce à l’attribution d’un identifiant pérenne ;
- Pour gérer les modalités de partage des données par l’attribution de licences de diffusion ;
- Pour se conformer aux exigences des financeurs et institutions sur l’ouverture des données ;
- Pour favoriser la reproductibilité de la recherche et son intégrité ;
- Pour valoriser les données par leur réutilisation dans de nouvelles études et innovations.
Il existe plusieurs catégories d’entrepôts :
- Thématiques ou disciplinaires : Nakala (SHS), GenBANK (séquences génétiques), Pangaea (sciences de la terre et de l’environnement), Protocols.io (protocoles) etc. ;
- Institutionnels : Cirad Dataverse, DataSuds (IRD) ;
- National : Recherche Data Gouv ;
- Génériques : Zenodo, Dryad, Figshare ;
- Liés à un éditeur ou une revue (tout en restant un entrepôt ouvert) : Mendeley (Elsevier), Harvard Dataverse (Ubiquity Press), etc.
Le choix d'un entrepôt
Le choix d’un entrepôt de données sera guidé par diverses considérations. Il convient avant tout de suivre les pratiques des communautés scientifiques et donc de déposer ses données de façon prioritaire dans un entrepôt thématique de confiance.
Depuis 2024, le collège Données de la recherche du Comité pour la science ouverte publie une liste évolutive des entrepôts thématiques de confiance, accompagnée d’une note méthodologique et d’une analyse de l’offre existante.
Si aucun entrepôt thématique n’est recommandé par votre communauté, il est conseillé de déposer vos données dans l’entrepôt de votre établissement s’il existe, ou sinon dans un entrepôt pluridisciplinaire, national (ex : Recherche Data Gouv en France) ou international (ex : Zenodo pour l’Europe).
Vous pouvez aussi consulter la liste des entrepôts de confiance validés par Recherche Data Gouv et mise à jour régulièrement.
Recherche Data Gouv
Au sein de l’écosystème du même nom, l’entrepôt national Recherche Data Gouv se veut une solution souveraine pour la publication et le partage des données de recherche achevées, et ce dans une démarche de science ouverte.
Cette solution est particulièrement adaptée quand les communautés scientifiques ne disposent pas, ou pas encore, d’un entrepôt thématique reconnu. Elle constitue une alternative aux offres émanant d’acteurs privés, qui aboutissent à une appropriation commerciale des données de la recherche publique.
L’Université de Limoges dispose d’un espace dédié qui regroupe des données de la recherche produites par ou en collaboration avec des équipes de recherche de l’université. Il vise ainsi à accroître la visibilité et l’accessibilité des données de la recherche de l’établissement ainsi qu’à assurer la valorisation, le partage et la préservation des données déposées.
L'entrepôt Data Université de Limoges
Data Université de Limoges est le nom de l’espace dédié à l’Université de Limoges sur l’entrepôt national Recherche Data Gouv. Il vous offre un espace de dépôt sécurisé pour mettre en ligne vos données de recherche et les partager.
L’administration et la curation sont assurés par l’Université de Limoges.
Pour démarrer sur Data Université de Limoges et l‘entrepôt Recherche Data Gouv :
- Une instance bac à sable (remise à zéro tous les mois) ;
- Des guides complets proposés par Recherche Data Gouv ;
- Des classes virtuelles également proposées par Recherche Data Gouv sur différents aspects fonctionnels.
Des annuaires d'entrepôts
Des annuaires d’entrepôts existent également pour vous aider dans votre choix :
- R3data : annuaire d’entrepôts ;
- FAIRsharing : portail web donnant à 3 répertoires interconnectés ;
- Cat OPIDoR avec des entrepôts par discipline ;
- Comment choisir un entrepôt de données : ressource Doranum
- En complément, le site Doranum recense et décrit une sélection d’entrepôts hébergés en France dans le domaine des sciences humaines et sociales.